悉尼大学澳大利亚野生动物基因组学小组的科学家们已将 116 只考拉的整个基因组加载到公共领域,以加速重要的基因组研究,以支持受威胁的物种。
由于悉尼大学和澳大利亚博物馆的联合工作,这只考拉的第一个完整参考基因组发布仅三年后。
在接下来的几个月里,450 个基因组将在Amazon Web Services 提供的服务器上提供,该服务通过覆盖与在云中托管大型数据集相关的存储和下载成本来积极支持重要的基因组研究。
科学家们将能够通过任何网络浏览器访问这些数据,并使用它来研究与考拉遗传多样性与疾病、繁殖、它们吃的食物以及它们如何适应不断变化的气候之间相互作用有关的关键问题。
悉尼大学生命与环境科学学院的项目联合研究员Carolyn Hogg 博士说:“该项目正在为考拉的分布范围开发基因组调查图。我们可以利用这些信息来发现和保护那些具有重要遗传变异的种群,这对于考拉能够适应不断变化的环境至关重要。
“通过与 AWS 开放数据集合作,我们能够在对样本进行测序后立即公开数据,以帮助加快对这一标志性物种的研究。”
在2021年2月宣布,计划从接受了$ 674,000人来自新南威尔士州政府的资金和$三十四万八千四百五十零联邦政府。
联邦环境部长 Sussan Ley 表示,该计划是莫里森政府对考拉计划投资 1800 万澳元的一部分。
“在受威胁物种委员会审查考拉的保护状况以及我们努力绘制种群地图和恢复栖息地时,悉尼大学研究团队正在共享数据,以便科学界的其他人可以帮助提供新的见解,以帮助解锁有关考拉的信息。考拉种群的健康和复原力,”莱伊部长说。
新南威尔士州就业、投资、旅游和西悉尼部长 Stuart Ayres 表示,这一重要里程碑将加速研究并将考拉保护工作提升到一个新的水平。
“刺激和支持前沿研究是解决当今和未来环境挑战的重要组成部分,”艾尔斯先生说。
“新南威尔士州政府很自豪能够通过这种研究与工业之间的合作来支持对考拉的保护,这将增强该州的生物信息学能力,并使研究人员能够开放获取重要数据。”
新南威尔士州首席科学家兼工程师 Hugh Durrant-Whyte 教授说:“目前关于新南威尔士州考拉的种群密度、遗传多样性和健康状况的信息有限。这项研究是到 2050 年将新南威尔士州考拉数量增加一倍的重要第一步。”
考拉正面临来自土地清理、气候变化、疾病和物种遗传多样性适应限制的越来越大的威胁。
悉尼大学的基因组工作由 Carolyn Hogg 博士和Kathy Belov 教授领导,是一项更广泛的计划的一部分,该计划旨在绘制 50 多种受威胁物种的基因组图,作为受威胁物种倡议的一部分。
别洛夫教授表示,明年该计划将重点研究其他物种的基因组,包括猫耳袋鼠、食蚁兽和已灭绝的圣诞岛野生石龙子。
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